Alors que la liaison ferroviaire Bordeaux-Lyon est suspendue depuis décembre 2012, officiellement pour une remise à niveau de la voie, une ligne FlixBus assure depuis le 3 mars le trajet entre les deux capitales régionales. À noter que Starshipper exploite de son côté une liaison similaire depuis janvier 2015.
La nouvelle ligne de FlixBus est quant à elle programmée deux fois par jour, dans les deux sens, via Angoulême, Guéret et Montluçon, trois villes qui n’étaient jusqu’alors pas desservies et qui permettent à l’opérateur de se proclamer « le numéro un en France en nombre de villes connectées ».
Par ailleurs, comme la liaison ferroviaire, la liaison routière dessert également Clermont-Ferrand six fois par jour, à partir de Limoges. Ces nouvelles lignes sont assurées par l’autocariste corrézien Serge Faure. FlixBus a annoncé mi-février avoir franchi le cap des 50 autocaristes partenaires depuis son lancement en France.